Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp20Q8C6M1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms