Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Usp38Q8BW70 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Usp38Q8BW70 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Usp38Q8BW70 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp38Q8BW70 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp38Q8BW70 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp38Q8BW70 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp38Q8BW70 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp38Q8BW70 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp38Q8BW70 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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