Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Snx17Q8BVL3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Snx17Q8BVL3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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