Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep55Q8BT07 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep55Q8BT07 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms