Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms