Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco3Q8BH01 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms