Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc172Q810N9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms