Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NanogQ80Z64 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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