Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AknaQ80VW7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AknaQ80VW7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms