Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrc1Q80VQ1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms