Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms