Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tnfsf18Q7TS55 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tnfsf18Q7TS55 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tnfsf18Q7TS55 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Tnfsf18Q7TS55 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tnfsf18Q7TS55 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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