Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LnpkQ7TQ95 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms