Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpv1Q704Y3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms