Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt9Q6RHW0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt9Q6RHW0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt9Q6RHW0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt9Q6RHW0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt9Q6RHW0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt9Q6RHW0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt9Q6RHW0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt9Q6RHW0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt9Q6RHW0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt9Q6RHW0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt9Q6RHW0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt9Q6RHW0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt9Q6RHW0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms