Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbtb40Q6PCS8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbtb40Q6PCS8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbtb40Q6PCS8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbtb40Q6PCS8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbtb40Q6PCS8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbtb40Q6PCS8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zbtb40Q6PCS8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Zbtb40Q6PCS8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zbtb40Q6PCS8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Zbtb40Q6PCS8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbtb40Q6PCS8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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