Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrig3Q6P1C6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms