Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms