Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tpm4Q6IRU2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tpm4Q6IRU2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Tpm4Q6IRU2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tpm4Q6IRU2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms