Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms