Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca2Q6DIC0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarca2Q6DIC0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms