Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrcc1Q69ZB0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms