Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna3Q65CL1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnna3Q65CL1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms