Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms