Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Zfp248Q640N4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zfp248Q640N4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zfp248Q640N4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zfp248Q640N4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zfp248Q640N4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zfp248Q640N4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zfp248Q640N4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zfp248Q640N4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zfp248Q640N4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Zfp248Q640N4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Zfp248Q640N4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zfp248Q640N4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Zfp248Q640N4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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