Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ss18Q62280 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms