Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbm38Q62176 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rbm38Q62176 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rbm38Q62176 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rbm38Q62176 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rbm38Q62176 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rbm38Q62176 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rbm38Q62176 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rbm38Q62176 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rbm38Q62176 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rbm38Q62176 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rbm38Q62176 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbm38Q62176 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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