Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ecm1Q61508 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms