Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msi1Q61474 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Msi1Q61474 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms