Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Cln3Q61124 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Cln3Q61124 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cln3Q61124 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cln3Q61124 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cln3Q61124 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cln3Q61124 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms