Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
JrkQ60976 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms