Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms