Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HellsQ60848 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HellsQ60848 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms