Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ppp1r1bQ60829 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms