Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot7Q60809 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms