Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Traf3Q60803 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Traf3Q60803 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3Q60803 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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