Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Samhd1Q60710 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samhd1Q60710 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms