Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb6Q60692 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb6Q60692 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms