Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Foxd4Q60688 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Foxd4Q60688 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Foxd4Q60688 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Foxd4Q60688 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Foxd4Q60688 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Foxd4Q60688 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxd4Q60688 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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