Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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PtprnQ60673 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtprnQ60673 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PtprnQ60673 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PtprnQ60673 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprnQ60673 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprnQ60673 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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PtprnQ60673 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtprnQ60673 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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