Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp13a3Q5XF89 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms