Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms