Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim38Q5SZ99 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim38Q5SZ99 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim38Q5SZ99 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim38Q5SZ99 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim38Q5SZ99 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim38Q5SZ99 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim38Q5SZ99 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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