Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme4Q5SSW2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms