Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Fam208bQ5DTT3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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