Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms