Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trappc3lQ4KL14 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3lQ4KL14 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms