Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxn3Q499D0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms