Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lin28bQ45KJ6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lin28bQ45KJ6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms