Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc110Q3V125 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms